在我們選擇熒光蛋白時(shí),首要考慮的是熒光蛋白的聚合性質(zhì),即是否會(huì)影響目的蛋白的功能及定位,其次是熒光蛋白的 PK 值是否與目的蛋白所處的環(huán)境的 pH 值相匹配,然后是熒光蛋白的成熟時(shí)間以及目的蛋白的壽命,綜合兩者決定熒光蛋白是否合適,zui后考慮熒光蛋白的光穩(wěn)定性、密碼子偏好性是否合適,zui后考慮目的蛋白放的位置,熒光蛋白是否會(huì)影響目的蛋白的功能及定位。
發(fā)光原理:
GFP的第65至67位的三個(gè)氨基酸(絲氨酸-酪氨酸-甘氨酸)殘基,可自發(fā)地形成一種熒光發(fā)色團(tuán)。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)鏈折疊時(shí),這段被深埋在蛋白質(zhì)內(nèi)部的氨基酸片段,得以“親密接觸",導(dǎo)致經(jīng)環(huán)化形成咪唑酮,并發(fā)生脫水反應(yīng)。在分子氧存在的條件下,發(fā)色團(tuán)可進(jìn)一步發(fā)生氧化脫氫,zui終成熟,形成可發(fā)射熒光的形式。具體過(guò)程為:在 O2存在下,GFP分子內(nèi)第67位甘氨酸的酰胺對(duì)第65位絲氨酸的羧基進(jìn)行親核攻擊,形成第5位碳原子咪唑基;第66位酪氨酸的α2β鍵脫氫反應(yīng)之后,導(dǎo)致芳香團(tuán)與咪唑基結(jié)合,并zui終自發(fā)催化形成對(duì)羥基苯甲酸咪唑環(huán)酮生色。
GFP需要在氧化狀態(tài)下產(chǎn)生熒光,強(qiáng)還原劑能使GFP轉(zhuǎn)變?yōu)榉菬晒庑问?,但一旦重新暴露在空氣或氧氣中,GFP熒光便立即得到恢復(fù)。一般來(lái)說(shuō)弱還原劑并不會(huì)影響GFP熒光,中度氧化劑如生物材料的固定,脫水劑戊二酸或甲醛等對(duì)GFP熒光影響也不大。
發(fā)光特性:
GFP吸收的光譜zui大峰值為395nm(紫外),并有一個(gè)峰值為470nm的副吸收峰(藍(lán)光);發(fā)射光譜zui大峰值為509nm(綠光),并帶有峰值為540nm的側(cè)峰(Shouder)。雖然450~490nm只是GFP的副吸收峰,但由于該激發(fā)光對(duì)細(xì)胞的傷害更小,因此通常多使用該波段光源(多為488nm)。此外,GFP的光譜特性與熒光素異硫氰酸鹽(FITC)很相似,兩者通常共有一套濾光片。GFP熒光極其穩(wěn)定,在激發(fā)光照射下,GFP抗光漂白(Photobleaching)能力比熒光素強(qiáng),特別是在450~490nm藍(lán)光波長(zhǎng)下更穩(wěn)定。類似的,GFP融合蛋白的熒光靈敏度遠(yuǎn)比熒光素標(biāo)記的熒光抗體高,抗光漂白能力強(qiáng),因此更適用于定量測(cè)定與分析。由于GFP熒光的產(chǎn)生不需要任何外源反應(yīng)底物,因此GFP作為一種廣泛應(yīng)用的活體報(bào)告蛋白,其作用是任何其它酶類報(bào)告蛋白的。但因?yàn)镚FP不是酶,熒光信號(hào)沒(méi)有酶學(xué)放大效果,因此GFP靈敏度可能低于某些酶類報(bào)告蛋白,比如螢火蟲(chóng)熒光素酶等
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